SuperDuper tarjoaa muokattavissa olevia käynnistyskelpoisia varmuuskopiojärjestelmiä, jotka mahdollistavat täydelliset, invertti-, uudet tai differentiaalivarmistukset turvatakseen kohteet, joilla on vaihtoehtoja lupakorjaukseen ja esi-/jälkitoteutusskripteihin.